No início da colonização do Brasil, o território onde hoje é Laguna representava o ponto extremo do sul do Brasil, na Capitania de Santana. Aqui passava a linha imaginária do Tratado de Tordesilhas, assinado em 1494 e que separava as terras de Portugal e Espanha. Por este motivo, Laguna tornou-se um importante ponto geográfico para Portugal.
   Em 1676 a vila de "Santo Antônio dos Anjos de Laguna" foi fundada pelo capitão vicentista Domingos de Brito Peixoto, sendo considerada a terceira cidade mais antiga de Santa Catarina.
   Do extenso território original de Laguna, desmembraram-se duas capitais brasileiras: Porto Alegre e Florianópolis, antiga Nossa Senhora do Desterro.
Em 1880 as freguesias mais importantes eram: Vila Nova, Santana do Mirim, Senhor Bom Jesus da Pescaria Brava, São João Batista do Imaruí e Nossa Senhora Mãe dos Homens do Araranguá.
   De Laguna originaram-se os municípios que hoje fazem parte da AMUREL (Associação do Municípios da Região da Laguna), entre eles o município de Tubarão, que atualmente é o maior da região. A AMUREL foi fundada em 1970 e conta hoje com dezessete municípios.
Durante a Revolução Farroupilha Laguna foi tomada pelos revolucionários e aqui foi proclamada a República Juliana, independente do Império Brasileiro e da República Rio-Grandense, mas confederada com esta última. Aqui nasceu Ana Maria de Jesus Ribeiro, conhecida como Anita Garibaldi, ou ainda Heroína de dois mundos, que aqui conheceu Giuseppe Garibaldi durante a Revolução Farroupilha e se casou com ele no Uruguai. Anita lutou tanto na Revolução Farroupilha quanto na Unificação da Itália.
   Laguna tem 336 anos e 27 anos de Tombamento Histórico. A cidade possui um poligonal de tombamento que compreende aproximadamente 600 edificações, que fazem parte de um dos mais valiosos e belos conjuntos arquitetônicos do país.